Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim12cD3Z3L3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms