Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tpm3-rs7D3Z2H9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms