Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms