Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cttnbp2B9EJA2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms