Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20547B8JJN0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20547B8JJN0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms