Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms