Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Abcc8B2RUS7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms