Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zscan5bB2RTN3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms