Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms