Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ythdc2B2RR83 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms