Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf3B2RQG2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf3B2RQG2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms