Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms