Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930402K13RikB1AW18 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms