Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm436B1AVU6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm436B1AVU6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms