Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930435E12RikA6X8Z9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms