Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Odf2A3KGV1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Odf2A3KGV1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Odf2A3KGV1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Odf2A3KGV1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Odf2A3KGV1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Odf2A3KGV1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Odf2A3KGV1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Odf2A3KGV1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Odf2A3KGV1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Odf2A3KGV1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Odf2A3KGV1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Odf2A3KGV1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Odf2A3KGV1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Odf2A3KGV1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Odf2A3KGV1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms