Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Htra4A2RT60 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms