Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramef17A2ASJ1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms