Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb1A2AQ07 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms