Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms