Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Frmpd1A2AKB4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Frmpd1A2AKB4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Frmpd1A2AKB4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms