Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Grin3aA2AIR5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms