Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ambra1A2AH22 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ambra1A2AH22 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms