Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm6268A2A3U9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6268A2A3U9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms