Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc112A0AUP1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc112A0AUP1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms