Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Hdac6Q9Z2V5 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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Hdac6Q9Z2V5 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Hdac6Q9Z2V5 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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