Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rabgef1Q9JM13 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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