Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rnft1Q9DCN7 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms