Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Rnf6Q9DBU5 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms