Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccdc47Q9D024 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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