Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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Zbtb40Q6PCS8 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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Zbtb40Q6PCS8 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms