Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NipblQ6KCD5 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NipblQ6KCD5 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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