Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Tsr1Q5SWD9 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms