Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
VdrP48281 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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VdrP48281 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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VdrP48281 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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VdrP48281 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
VdrP48281 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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