Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms