Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc11P31313 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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