Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms