Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Spocd1B1ASB6 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Spocd1B1ASB6 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Spocd1B1ASB6 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Spocd1B1ASB6 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Spocd1B1ASB6 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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Spocd1B1ASB6 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Spocd1B1ASB6 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Spocd1B1ASB6 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Spocd1B1ASB6 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Spocd1B1ASB6 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Spocd1B1ASB6 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Spocd1B1ASB6 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Spocd1B1ASB6 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Spocd1B1ASB6 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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