Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Grik3B1AS29 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Grik3B1AS29 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms