Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hdac6Q9Z2V5 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms