Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp29Q9ES63 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp29Q9ES63 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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