Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SgshQ9EQ08 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.6 ms