Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxa13Q62424 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms