Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm14890-201ENSMUST00000117660 676 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sft2d1Q5SSN7 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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