Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Usp48Q3V0C5 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp48Q3V0C5 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms