Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trim71Q1PSW8 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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