Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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ptchd1Q14B62 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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ptchd1Q14B62 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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ptchd1Q14B62 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ptchd1Q14B62 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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