Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp46P62069 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp46P62069 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms