Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprkP35822 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprkP35822 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprkP35822 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprkP35822 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprkP35822 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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