Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtprmP28828 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtprmP28828 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PtprmP28828 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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PtprmP28828 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PtprmP28828 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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